实验室实行“ 开放、流动、联合、竞争” 的运行机制。大型仪器设备有专人负责管理，对校内外实行开放共享，为保证实验安全及实验规范，实验室对申请进行实验的老师和研究生均实行岗前培训、实验仪器和实验项目培训制度，集中培训后进行考核，考核合格者获上岗证。

    实验室建设期间购置透射电子显微镜、超高效液相色谱串联四级杆飞行时间质谱联用仪、流式细胞分选仪、超薄切片机、四通道血小板聚集仪等大型仪器设备（市值超 2000 万元）。实验室 30 万元以上大型仪器均已加入安徽省大型科学仪器设备共享服务平台，对全社会开放，目前大型仪器使用率较高，如液质联用仪年使用时间为 1500 小时/台、流式细胞仪年使用时间400 小时/台、高效液相色谱仪年使用时间 2000 小时/台。

    实验室依托学校大型设备开放平台，将所有大型仪器设备纳入对外开放，实行预约管理，运行良好。目前开放共享仪器设备数 32 台，科研仪器设备使用率、外服务率等逐年提升。实验室专业性技术创新平台、科技创新创业服务机构服务水平均进一步得到提高。依托 2018 年度安徽省中央引导地方科技发展专项资金项目购置超薄切片机，改造升级了实验室透射电子显微镜实验技术平台，依托 2019 年度中央支持地方科技发展资金项目购置高端细胞分选系统，完善实验室细胞分子生物学技术平台，进一步提升了实验室对校内外的科研服务能力。